184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1146 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1146  UspA domain protein  100 
 
 		 156 aa  323  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  30.72 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.65 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.88 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.55 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  35.95 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.48 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.87 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.19 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.7 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  27.92 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.03 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  27.45 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.45 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.16 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.87 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.61 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.61 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  27.7 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.17 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  30.92 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  30.63 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  30.63 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.25 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  27.56 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30.72 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30.95 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  27.74 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.92 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.14 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.14 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.17 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  27.45 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.38 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.03 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.28 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  29.53 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.67 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  27.27 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.29 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.46 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  28.28 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.34 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  26.97 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.75 
 
 		 281 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.1 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.33 
 
 		 290 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  27.52 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.17 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  27.91 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.75 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.8 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.15 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  26.67 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  25.73 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  26.85 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  25.81 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  44.64 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  26.75 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  28.77 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  26.14 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  28.93 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  25.31 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  26.14 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  25.49 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.76 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>