More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0960 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.27 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  24.44 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  26.04 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  48 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>