More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5682 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5682  porin  100 
 
 		 351 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  66.49 
 
 		 362 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  67.76 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  67.9 
 
 		 344 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  42.52 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  41.07 
 
 		 387 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  41.97 
 
 		 414 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  40.65 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  43.22 
 
 		 385 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  41.06 
 
 		 381 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  42.42 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  40.9 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  41.94 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  39.89 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  40.67 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  34.98 
 
 		 426 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  39.12 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  36.53 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  37.92 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  35.12 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  37.63 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  34.93 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  35.75 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.57 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  36.39 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  34.04 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  35.25 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  36.14 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  35.42 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  36.36 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  33.24 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  34.29 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  33.72 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  34.29 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  33.52 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  35.05 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  33.52 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  33.82 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.43 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  36.96 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  33.07 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  34.38 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  33.24 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  31.46 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  31.89 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  33.33 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  35.23 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  33.6 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  34.06 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.08 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.59 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.58 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.7 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  30.13 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  33.9 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  31.5 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.33 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.51 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.51 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.09 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.15 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.15 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.09 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.15 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.43 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  32.37 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.43 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.43 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  30.73 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.5 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.85 
 
 		 368 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  33.24 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.08 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  31.81 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.43 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  33.25 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  29.74 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  34.72 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  34.72 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  29.44 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.51 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.23 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  32.51 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  32.02 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  30 
 
 		 359 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  30.77 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.17 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  30.13 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  30.13 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  30.69 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  32.28 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.12 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  32.28 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.37 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.94 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.91 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.37 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  32.73 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>