105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0021 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 522 aa  1045    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  44.62 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  31.5 
 
 		 511 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  25.15 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  26 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  24.4 
 
 		 530 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  24.16 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  24.16 
 
 		 520 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  23.02 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  21.81 
 
 		 536 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  21.27 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  20.38 
 
 		 567 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  21.91 
 
 		 481 aa  97.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  19.57 
 
 		 509 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  58.14 
 
 		 208 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64.1 
 
 		 192 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  55.56 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 128 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  48.84 
 
 		 539 aa  52  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  51.11 
 
 		 320 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  29.32 
 
 		 467 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  39.71 
 
 		 503 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 327 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.81 
 
 		 543 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  41.86 
 
 		 130 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  45.24 
 
 		 204 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  45.65 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  37.29 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 661 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  53.49 
 
 		 338 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  51.11 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  38.18 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  51.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  48.89 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  48.89 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  32.97 
 
 		 255 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  48.89 
 
 		 674 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  46.67 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 561 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  48.89 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 		 267 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21430  hypothetical protein  17.54 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  36.92 
 
 		 849 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 		 307 aa  47  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 168 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.65 
 
 		 75 aa  47  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 754 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 159 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  46.67 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  42.22 
 
 		 283 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  46.51 
 
 		 314 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  26.14 
 
 		 514 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  36.67 
 
 		 324 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  42.55 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.03 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4365  Peptidoglycan-binding LysM  44.19 
 
 		 229 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  53.33 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  42.22 
 
 		 301 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 618 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  42.86 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  52.5 
 
 		 587 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  52.5 
 
 		 621 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 499 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  42.86 
 
 		 604 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  52.5 
 
 		 609 aa  44.3  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 142 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  45.65 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  52.5 
 
 		 615 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  41.86 
 
 		 261 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  38.3 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  38.3 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 519 aa  43.9  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  44.19 
 
 		 284 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  36.17 
 
 		 1556 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 446 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  43.75 
 
 		 253 aa  43.9  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  34.78 
 
 		 253 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.43 
 
 		 532 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  52.5 
 
 		 613 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 797 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.78 
 
 		 274 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>