More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4024 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  37.44 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  36.92 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 223 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  38.06 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  38.06 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  38.06 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  38.06 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  38.06 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  37.88 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  37.98 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  33.88 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  36.56 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  32.48 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>