88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4439 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 727 aa  1481    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  48.54 
 
 		 535 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  39.41 
 
 		 693 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  46.86 
 
 		 547 aa  314  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  46.17 
 
 		 567 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  43.83 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  39.92 
 
 		 850 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  40.57 
 
 		 407 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  36 
 
 		 541 aa  273  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  37.41 
 
 		 408 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  41.73 
 
 		 548 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  38.56 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  40.72 
 
 		 471 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  38.75 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  37.59 
 
 		 403 aa  255  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 604 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  37.47 
 
 		 568 aa  250  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  37.37 
 
 		 387 aa  247  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  34.74 
 
 		 411 aa  246  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  34.09 
 
 		 399 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  36.41 
 
 		 558 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  33.41 
 
 		 636 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  32.75 
 
 		 413 aa  177  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.83 
 
 		 535 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  29.46 
 
 		 631 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  31.94 
 
 		 583 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  31.81 
 
 		 640 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  29.4 
 
 		 535 aa  161  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  40.28 
 
 		 1548 aa  157  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  29.76 
 
 		 532 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  33.13 
 
 		 320 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  28.74 
 
 		 658 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  28.24 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  30.31 
 
 		 434 aa  144  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  28.81 
 
 		 589 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  30.93 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  31.01 
 
 		 469 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.58 
 
 		 445 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  26.91 
 
 		 677 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1176 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.91 
 
 		 737 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.52 
 
 		 1357 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  27.14 
 
 		 612 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  28.33 
 
 		 450 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  24.67 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25.26 
 
 		 453 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  27.89 
 
 		 587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.95 
 
 		 1212 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  25.76 
 
 		 445 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  25.71 
 
 		 446 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  36.17 
 
 		 778 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  26.89 
 
 		 427 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  38.66 
 
 		 1465 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 		 794 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  27.56 
 
 		 442 aa  99.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2645  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosaminidase  43.96 
 
 		 512 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.708855  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  27.13 
 
 		 440 aa  97.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.32 
 
 		 435 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  24.36 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25.29 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2597  hypothetical protein  23.7 
 
 		 264 aa  76.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  33.86 
 
 		 1084 aa  74.7  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.22 
 
 		 986 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.22 
 
 		 986 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  34.22 
 
 		 986 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.22 
 
 		 986 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.22 
 
 		 955 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  34.22 
 
 		 986 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.22 
 
 		 955 aa  72  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.24 
 
 		 964 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  31.01 
 
 		 864 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  25.98 
 
 		 1089 aa  65.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  29.11 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  32.67 
 
 		 657 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  25.38 
 
 		 1075 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.9 
 
 		 683 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1375 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  24.39 
 
 		 684 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0628  hypothetical protein  32.12 
 
 		 694 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6291  hypothetical protein  21.67 
 
 		 195 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  31.46 
 
 		 733 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  31.46 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 727 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.77 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  27.56 
 
 		 708 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  27.56 
 
 		 708 aa  44.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  25.11 
 
 		 768 aa  44.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  27.56 
 
 		 708 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>