More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03930 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  100 
 
 		 414 aa  841    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  77.11 
 
 		 417 aa  600  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  70.48 
 
 		 422 aa  587  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  72.3 
 
 		 389 aa  587  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  79.22 
 
 		 410 aa  578  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  45.05 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  46.21 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  47.7 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  47.97 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  46.15 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  46.28 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  46.28 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  46.01 
 
 		 407 aa  338  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  47.04 
 
 		 412 aa  336  5e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  45.97 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  44.44 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  46.22 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  43.24 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  45.33 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  46.01 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  45.83 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  43.32 
 
 		 426 aa  318  9e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  43.25 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  43.01 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  45 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  46.02 
 
 		 379 aa  312  5.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  43.05 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  42.86 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  43.01 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  43 
 
 		 436 aa  308  8e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  42.93 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  42.19 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  53.48 
 
 		 284 aa  306  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  43.44 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  42.01 
 
 		 402 aa  302  6.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  38.65 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.2 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  42.36 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  42.36 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  52.26 
 
 		 429 aa  288  9e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  37.53 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  43.99 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  51.24 
 
 		 446 aa  286  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  35.91 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  41.13 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  42.4 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  39.36 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  43.71 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  43.56 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  41.18 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  36.87 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  48.59 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  40.7 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  43.38 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  43.07 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  44.69 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  40.21 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.63 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  45.18 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  39.11 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  41.74 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  41.42 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  37.18 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  39.33 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.63 
 
 		 757 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 732 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.81 
 
 		 754 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.23 
 
 		 718 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.4 
 
 		 800 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.64 
 
 		 784 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.91 
 
 		 738 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.25 
 
 		 781 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.18 
 
 		 756 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  45.7 
 
 		 764 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46 
 
 		 719 aa  216  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.93 
 
 		 810 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.42 
 
 		 754 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.06 
 
 		 723 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.8 
 
 		 727 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.67 
 
 		 739 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.83 
 
 		 754 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.32 
 
 		 754 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.71 
 
 		 731 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.49 
 
 		 736 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.09 
 
 		 740 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  45.38 
 
 		 776 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.59 
 
 		 731 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.13 
 
 		 743 aa  213  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.75 
 
 		 697 aa  212  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 		 804 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.3 
 
 		 721 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  42.97 
 
 		 641 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.19 
 
 		 759 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.35 
 
 		 781 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.8 
 
 		 731 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 737 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.92 
 
 		 685 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.78 
 
 		 735 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  44.89 
 
 		 722 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.3 
 
 		 740 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>