128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3802 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3802  protease  100 
 
 		 778 aa  1603    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1406 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  42.24 
 
 		 692 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  41.29 
 
 		 1362 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  26.24 
 
 		 513 aa  114  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  58.59 
 
 		 1152 aa  108  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  28.25 
 
 		 998 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  25.45 
 
 		 1004 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  25 
 
 		 735 aa  95.9  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.85 
 
 		 915 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  24.81 
 
 		 733 aa  94.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  57.32 
 
 		 1414 aa  92  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  48.54 
 
 		 1059 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  48.42 
 
 		 703 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  27.2 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  29.58 
 
 		 1132 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1764  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.97 
 
 		 1356 aa  82  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.420285  normal  0.647474 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  23.83 
 
 		 1096 aa  81.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  23.91 
 
 		 1028 aa  81.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  54.08 
 
 		 979 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  43.68 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  47.19 
 
 		 1295 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  41.41 
 
 		 1123 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  38.41 
 
 		 991 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  42.39 
 
 		 1275 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  50 
 
 		 1002 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  25.38 
 
 		 994 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.51 
 
 		 984 aa  68.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  41.24 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  44.83 
 
 		 846 aa  68.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  48.35 
 
 		 1247 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  48.31 
 
 		 1474 aa  67.4  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  48.86 
 
 		 1585 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  48.86 
 
 		 1217 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1076 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  38.32 
 
 		 1053 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  35 
 
 		 848 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  37.3 
 
 		 1054 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  43.68 
 
 		 846 aa  64.7  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  36.94 
 
 		 1285 aa  64.7  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  27.01 
 
 		 1024 aa  64.3  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  39.33 
 
 		 1748 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  42.86 
 
 		 1051 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 		 963 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  30.83 
 
 		 1444 aa  61.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  24.83 
 
 		 885 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.31 
 
 		 767 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  37.11 
 
 		 974 aa  58.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  27.61 
 
 		 965 aa  58.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  35.14 
 
 		 1601 aa  57.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  41.76 
 
 		 1146 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  29.59 
 
 		 795 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  29.33 
 
 		 951 aa  57.4  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1825 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  23.06 
 
 		 652 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  39.47 
 
 		 1160 aa  55.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  40 
 
 		 491 aa  55.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  30.12 
 
 		 938 aa  54.7  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  31.87 
 
 		 343 aa  54.7  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  26.48 
 
 		 794 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  25.87 
 
 		 794 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  42.86 
 
 		 1219 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  29.03 
 
 		 795 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  28.95 
 
 		 951 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  27.81 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.14 
 
 		 927 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  26.3 
 
 		 812 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  28.4 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 1129 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  29.03 
 
 		 795 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  27.81 
 
 		 795 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1204 aa  52  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  35.23 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  36.36 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  30.91 
 
 		 795 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  30.91 
 
 		 795 aa  51.2  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  30.91 
 
 		 795 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  30.91 
 
 		 795 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.74 
 
 		 796 aa  50.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  34.04 
 
 		 1047 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.05 
 
 		 1143 aa  50.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 		 1224 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  30.63 
 
 		 796 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.92 
 
 		 550 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.22 
 
 		 747 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  25.85 
 
 		 799 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  35.9 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  39.56 
 
 		 482 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 		 1127 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  30.63 
 
 		 796 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  30.63 
 
 		 796 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 1127 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  30 
 
 		 799 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>