266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0409 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 851 aa  1757    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 937 aa  301  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1409 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1054 aa  210  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1365 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  23.41 
 
 		 1475 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.03 
 
 		 1186 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 454 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  32.46 
 
 		 1328 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 1162 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.13 
 
 		 1162 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  32.46 
 
 		 919 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.58 
 
 		 991 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1039 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.51 
 
 		 968 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 911 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 751 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 568 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 568 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 767 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1215 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1060 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.44 
 
 		 825 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 949 aa  108  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 885 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 444 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  31.88 
 
 		 1507 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.27 
 
 		 771 aa  105  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 1424 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.8 
 
 		 828 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.37 
 
 		 2741 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.16 
 
 		 2741 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1105 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 854 aa  102  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 924 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.77 
 
 		 787 aa  101  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  33.67 
 
 		 680 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 		 1288 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.49 
 
 		 725 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  29.77 
 
 		 311 aa  100  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  32.48 
 
 		 1044 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 814 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1550 aa  99.4  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.31 
 
 		 1009 aa  99  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.13 
 
 		 532 aa  98.2  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 481 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 		 1262 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.74 
 
 		 493 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  29.83 
 
 		 799 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  30.59 
 
 		 822 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1025 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 843 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.58 
 
 		 2145 aa  94  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.63 
 
 		 1131 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 443 aa  93.2  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1238 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 284 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 362 aa  92.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.96 
 
 		 672 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  30.87 
 
 		 884 aa  91.3  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  30.05 
 
 		 840 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  29.65 
 
 		 717 aa  90.1  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  33.51 
 
 		 977 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 953 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  31.72 
 
 		 845 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 669 aa  88.6  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 		 1050 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 916 aa  87.4  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 		 1128 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.89 
 
 		 732 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.56 
 
 		 1488 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  31.49 
 
 		 212 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 		 1185 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  30.3 
 
 		 893 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1212 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 1290 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.4 
 
 		 1040 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  29.17 
 
 		 960 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 883 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27 
 
 		 919 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 809 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  25.66 
 
 		 963 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.15 
 
 		 740 aa  79.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 991 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.18 
 
 		 801 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 846 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  28.5 
 
 		 903 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1246 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 868 aa  74.7  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.07 
 
 		 1228 aa  74.3  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 822 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 469 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 162 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.41 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  28.98 
 
 		 944 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.56 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>