96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3845 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 372 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  64.11 
 
 		 381 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  25.28 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  30.96 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  23.2 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  23.06 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.37 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  23.53 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  22.04 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  25.84 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  23.46 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  19.15 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  21.39 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  34.32 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  24.8 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  24.81 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  25.56 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  23.66 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.04 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  24.73 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  24.45 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  24.74 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  26.61 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  24.45 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  25.56 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  19.75 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  23.22 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  26.86 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.71 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  26.86 
 
 		 364 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  43.08 
 
 		 128 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  26.27 
 
 		 568 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 191 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  25.53 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  35.53 
 
 		 589 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 213 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 213 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  24.58 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  26.5 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 588 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 		 578 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.8 
 
 		 1021 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 313 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  24.06 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  19.56 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 360 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 		 229 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>