261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2290 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  100 
 
 		 346 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  44.77 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  42.53 
 
 		 373 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  42.4 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  42.98 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  43.68 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  39.17 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  40.59 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  37.71 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  32.92 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  34.34 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  28.29 
 
 		 383 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  29.78 
 
 		 277 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  28.32 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  25.89 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.44 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  31.78 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  28.39 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  27.33 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  26.43 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  27.03 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  25.2 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  26.34 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  27.56 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  27.4 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.61 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  25.22 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.49 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.49 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  26.13 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.49 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  28.03 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  27.78 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.31 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  27.72 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  26.59 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  27.03 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  25.16 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.31 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  26.26 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  25.18 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.72 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.76 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.21 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  24.68 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  27.89 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.75 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  29.21 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  24.38 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.78 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  25.51 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  32.31 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  24.73 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  25.51 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  27.84 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.68 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  31.9 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  30.6 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.33 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.43 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  25.54 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.56 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  24.04 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.28 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  24.84 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  23.38 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.51 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.51 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.53 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  24.58 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  28.28 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  27.44 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  24.33 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  26.71 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.9 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>