242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3156 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 357 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  58.68 
 
 		 368 aa  381  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.33 
 
 		 782 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  31.23 
 
 		 985 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 		 1266 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1313 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 725 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 991 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  28.82 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1060 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1101 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  26.69 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 		 957 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 		 828 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.86 
 
 		 825 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 1186 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  28.51 
 
 		 689 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1238 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 1162 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1162 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.92 
 
 		 609 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 923 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.89 
 
 		 2145 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1063 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  23.83 
 
 		 1914 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1596 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 1054 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.86 
 
 		 1147 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 1714 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25 
 
 		 1550 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 1295 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1526 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 		 852 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.72 
 
 		 941 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.49 
 
 		 1009 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.03 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 751 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  22.08 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  23.99 
 
 		 1025 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 843 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  24.87 
 
 		 783 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 850 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1212 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 924 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  26.91 
 
 		 834 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.28 
 
 		 999 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  25.48 
 
 		 790 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 1048 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 		 636 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  24.66 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.73 
 
 		 1106 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 907 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 1279 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  25.09 
 
 		 1021 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1285 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  19.25 
 
 		 1180 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  25.24 
 
 		 981 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  25.75 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 1261 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  24.88 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.4 
 
 		 1020 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 971 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  28.49 
 
 		 1013 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1025 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.57 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  25.28 
 
 		 1033 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  23.53 
 
 		 799 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  28.39 
 
 		 1088 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24 
 
 		 1468 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1215 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 		 1507 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  26.55 
 
 		 965 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1105 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.27 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.17 
 
 		 1040 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1298 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 1271 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  27.78 
 
 		 680 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 714 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  26.77 
 
 		 919 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 742 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1039 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  25.3 
 
 		 992 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.21 
 
 		 1328 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.7 
 
 		 885 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  26.34 
 
 		 991 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 		 1288 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 		 833 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  30 
 
 		 603 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>