71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0305 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  98.51 
 
 		 603 aa  1200    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 603 aa  1216    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  51.47 
 
 		 613 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  51.14 
 
 		 613 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0772  TPR repeat-containing protein  49.28 
 
 		 636 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2275  TPR repeat-containing protein  45.78 
 
 		 628 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  30.16 
 
 		 782 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  32.16 
 
 		 985 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  29.39 
 
 		 1266 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 		 991 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  27.43 
 
 		 364 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1101 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1313 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1060 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.29 
 
 		 828 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  31.1 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 923 aa  63.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1298 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 1279 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1063 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 		 957 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 		 809 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 		 1162 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  27.16 
 
 		 941 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  23.71 
 
 		 1020 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.73 
 
 		 609 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  22.22 
 
 		 775 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  24.28 
 
 		 340 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  25.23 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 		 725 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 1162 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 357 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 343 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1025 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  22.58 
 
 		 1021 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25.54 
 
 		 971 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  27.17 
 
 		 568 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  25.14 
 
 		 928 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.49 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 287 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.63 
 
 		 1131 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1238 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  24.29 
 
 		 844 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.4 
 
 		 1468 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.78 
 
 		 2145 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 1195 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  22.39 
 
 		 946 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  29.84 
 
 		 978 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1113  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 478 aa  47.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0928766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1916  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1172 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.506674  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.39 
 
 		 852 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 760 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1596 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  22.73 
 
 		 992 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  21.27 
 
 		 1048 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 850 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  22.45 
 
 		 788 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  22.03 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  24.86 
 
 		 1013 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  25.99 
 
 		 993 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  23.68 
 
 		 934 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  24.32 
 
 		 965 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 368 aa  44.3  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.4 
 
 		 1145 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 425 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 949 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>