67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2275 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2275  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 628 aa  1251    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  54.6 
 
 		 613 aa  668    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  53.08 
 
 		 613 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0772  TPR repeat-containing protein  47.61 
 
 		 636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  45.62 
 
 		 603 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  45.62 
 
 		 603 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 		 782 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  30.57 
 
 		 985 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1313 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1063 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  29.7 
 
 		 689 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1101 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.25 
 
 		 1266 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  28.16 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.11 
 
 		 809 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  32.28 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1060 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  27.91 
 
 		 1020 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.24 
 
 		 941 aa  61.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  25.12 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 1048 aa  57.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1238 aa  57.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 991 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1162 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  26.64 
 
 		 816 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.7 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 		 1162 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1298 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.32 
 
 		 852 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 		 957 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.65 
 
 		 1468 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 828 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.18 
 
 		 1009 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  25.51 
 
 		 999 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 923 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 978 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 775 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.8 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 571 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1025 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1261 aa  50.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 		 636 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  28.33 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.84 
 
 		 609 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 850 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  25.64 
 
 		 965 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1596 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  33.15 
 
 		 991 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.53 
 
 		 1147 aa  47.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1526 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 760 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  26.32 
 
 		 981 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.05 
 
 		 1441 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.53 
 
 		 945 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 992 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 621 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  37.23 
 
 		 2145 aa  45.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 		 1429 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 971 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  26.74 
 
 		 1103 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1450 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  24.48 
 
 		 827 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 907 aa  43.9  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  27.65 
 
 		 1108 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.47 
 
 		 755 aa  43.5  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>