More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0093 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 215 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.46 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.98 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  30.37 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.85 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.2 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 194 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  24.88 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25.29 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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