More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3582 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  66.08 
 
 		 181 aa  221  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  62.86 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 181 aa  187  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  65.45 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  60.98 
 
 		 204 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  51.69 
 
 		 240 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  38.6 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  45.51 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  41.42 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  41.72 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  36.13 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.05 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  41.27 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  44.64 
 
 		 247 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  57.45 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  33.88 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  30.51 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 677 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>