97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2301 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  100 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  100 
 
 		 242 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.62 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.82 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  39.24 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  36.49 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  33.12 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2304  TonB family protein  30.23 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  34.78 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  31.84 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  26.29 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  35.14 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  30.25 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  40.91 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  28.47 
 
 		 443 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  36.51 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  31.52 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  28.66 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  36.51 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  26.42 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33.33 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  36.92 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  36.51 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  38.81 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.54 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  40.3 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  29.36 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  30.86 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  39.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  27.94 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  26.47 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  31.75 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  28.49 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0881  TonB family protein  27.06 
 
 		 487 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  27.32 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0907  TonB family protein  27.06 
 
 		 479 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.372258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.75 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  30.77 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  42.11 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  43.1 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  28.06 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  37.14 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  27.22 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  43.55 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  33.65 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2113  TonB-like protein  34.18 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  30.88 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1947  TonB family protein  29.41 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  32.14 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  25 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  34.18 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0914  TonB family protein  35.94 
 
 		 174 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  31.31 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  37.14 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  37.18 
 
 		 117 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  42.86 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  28.17 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  38.46 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  25.23 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  46.15 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  29.35 
 
 		 296 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  24.77 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  23.53 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  26.98 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  42.65 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  32.04 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  31.75 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.9 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40.74 
 
 		 441 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  27.34 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  31.25 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.73 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  25.68 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  36.36 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  39.62 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.58 
 
 		 1888 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  35.59 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  38.89 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  31.96 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  32.81 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  41.51 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  44.23 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  33.9 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  27.46 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  27.46 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.63 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  28.02 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  27.74 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  29.9 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  33.93 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  32.94 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  28.4 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  23.98 
 
 		 431 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  35.62 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  42.86 
 
 		 299 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  31.03 
 
 		 276 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  42.86 
 
 		 300 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>