More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0750 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  57.53 
 
 		 590 aa  674    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  57.76 
 
 		 584 aa  662    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  58.1 
 
 		 603 aa  701    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  59.21 
 
 		 584 aa  673    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 601 aa  1217    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  59.55 
 
 		 584 aa  678    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  57.8 
 
 		 583 aa  672    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.6 
 
 		 601 aa  629  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  52.45 
 
 		 598 aa  618  1e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  49.33 
 
 		 588 aa  598  1e-170  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  42.26 
 
 		 582 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.03 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  40.76 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  34.56 
 
 		 719 aa  360  4e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  34.35 
 
 		 803 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  35.77 
 
 		 651 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  36.33 
 
 		 568 aa  332  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  33.66 
 
 		 664 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  32.43 
 
 		 932 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  34.72 
 
 		 567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.31 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.4 
 
 		 552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.14 
 
 		 562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.2 
 
 		 550 aa  266  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.07 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  27.7 
 
 		 944 aa  258  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.61 
 
 		 556 aa  258  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  32.65 
 
 		 546 aa  258  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.84 
 
 		 573 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  30.1 
 
 		 816 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.39 
 
 		 573 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.8 
 
 		 592 aa  251  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.73 
 
 		 548 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.76 
 
 		 547 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.8 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.81 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  33.83 
 
 		 508 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.43 
 
 		 531 aa  211  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  34.03 
 
 		 513 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.42 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  34.39 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  34.25 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  31.68 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  31.16 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  31.35 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  31.35 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  31.35 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.31 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  34.11 
 
 		 534 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  31.71 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.85 
 
 		 510 aa  170  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.19 
 
 		 506 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  31.71 
 
 		 507 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.33 
 
 		 539 aa  159  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  29.28 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  32.16 
 
 		 519 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.31 
 
 		 522 aa  153  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.61 
 
 		 592 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  32.36 
 
 		 337 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  31.86 
 
 		 537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.29 
 
 		 1017 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  35.58 
 
 		 442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  28.12 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  28.71 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  30.89 
 
 		 509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  26.09 
 
 		 552 aa  120  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  25.77 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  26.7 
 
 		 561 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.65 
 
 		 797 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  27.45 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  34.68 
 
 		 831 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  26.65 
 
 		 530 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  28.9 
 
 		 316 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  27.92 
 
 		 558 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  27.65 
 
 		 562 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  28.15 
 
 		 550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  22.64 
 
 		 1009 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  27.79 
 
 		 567 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  27.17 
 
 		 552 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  25.42 
 
 		 552 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1105  ATP-dependent DNA ligase  26.18 
 
 		 552 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  27.11 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1145  ATP-dependent DNA ligase  25.84 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.646236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  25.38 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1134  ATP-dependent DNA ligase  27.33 
 
 		 553 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  24.53 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  32.35 
 
 		 832 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  24.83 
 
 		 551 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  25.21 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  25.95 
 
 		 551 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  29.27 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  29.71 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  29.41 
 
 		 656 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  26.3 
 
 		 307 aa  104  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  28.32 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  28.99 
 
 		 877 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  33.09 
 
 		 847 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  28.87 
 
 		 574 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  30.03 
 
 		 766 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>