More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI04170 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  47.46 
 
 		 932 aa  689    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  100 
 
 		 803 aa  1627    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  52.72 
 
 		 719 aa  691    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  53.21 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  46.15 
 
 		 651 aa  529  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  34.86 
 
 		 944 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.52 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  37.68 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  35.78 
 
 		 816 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.16 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  37.26 
 
 		 584 aa  372  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 584 aa  361  3e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  34.56 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  35.62 
 
 		 584 aa  350  5e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  34.03 
 
 		 601 aa  350  7e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.33 
 
 		 601 aa  341  2e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  32.79 
 
 		 598 aa  333  7.000000000000001e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.3 
 
 		 582 aa  291  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  34.05 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.13 
 
 		 583 aa  273  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.24 
 
 		 550 aa  248  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  31.65 
 
 		 568 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.41 
 
 		 552 aa  232  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  30.93 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.3 
 
 		 562 aa  220  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.55 
 
 		 573 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.4 
 
 		 553 aa  212  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.15 
 
 		 567 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.69 
 
 		 573 aa  211  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.32 
 
 		 556 aa  211  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.43 
 
 		 573 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.71 
 
 		 573 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.9 
 
 		 548 aa  208  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  30.58 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.9 
 
 		 592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.86 
 
 		 594 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.96 
 
 		 610 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  36.07 
 
 		 337 aa  179  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.41 
 
 		 531 aa  163  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.82 
 
 		 510 aa  161  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.37 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.53 
 
 		 509 aa  151  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  29.39 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  28.95 
 
 		 508 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  30.97 
 
 		 513 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  28.19 
 
 		 511 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  29.11 
 
 		 534 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  29.49 
 
 		 527 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  27.64 
 
 		 1009 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  30.91 
 
 		 513 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  27.45 
 
 		 507 aa  131  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.3 
 
 		 1017 aa  124  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  23.92 
 
 		 994 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.37 
 
 		 539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.63 
 
 		 522 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  30.22 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.23 
 
 		 592 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  28.12 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  28.1 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  27.87 
 
 		 503 aa  111  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  31.71 
 
 		 847 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  27.03 
 
 		 507 aa  109  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  28.06 
 
 		 576 aa  108  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  28.8 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  29.38 
 
 		 351 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  26.2 
 
 		 939 aa  104  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  27.88 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  28.21 
 
 		 316 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  23.43 
 
 		 1065 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  24.8 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  28.18 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  26.57 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.85 
 
 		 506 aa  102  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  28.41 
 
 		 533 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.93 
 
 		 436 aa  101  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  28.03 
 
 		 558 aa  100  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  26.53 
 
 		 530 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  26.92 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30 
 
 		 495 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  31.01 
 
 		 831 aa  99.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  27.49 
 
 		 558 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.01 
 
 		 763 aa  99  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  26.96 
 
 		 532 aa  98.2  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  28.97 
 
 		 321 aa  98.2  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  27.62 
 
 		 533 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.67 
 
 		 758 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.67 
 
 		 758 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  24.93 
 
 		 546 aa  97.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  27.86 
 
 		 532 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  27.49 
 
 		 871 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  28.92 
 
 		 766 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  24 
 
 		 531 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 759 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  25.64 
 
 		 546 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  26.76 
 
 		 545 aa  95.5  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  25.64 
 
 		 546 aa  94.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  27.79 
 
 		 833 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>