More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2882 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  57.06 
 
 		 550 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  100 
 
 		 547 aa  1119    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  54.73 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  53.37 
 
 		 556 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  55.39 
 
 		 548 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  43.69 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  43.77 
 
 		 552 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  41.18 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  41.25 
 
 		 568 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.58 
 
 		 592 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.13 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.23 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.97 
 
 		 573 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.09 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.44 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.1 
 
 		 594 aa  351  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.56 
 
 		 573 aa  350  4e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.39 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.64 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  33.67 
 
 		 603 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  32.47 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  31.77 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  31.77 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  31.52 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.47 
 
 		 590 aa  261  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.24 
 
 		 601 aa  253  8.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.25 
 
 		 582 aa  243  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  35.81 
 
 		 507 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.7 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  33.46 
 
 		 513 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  34.51 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  32.76 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.41 
 
 		 583 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  32.97 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  30.77 
 
 		 803 aa  223  9e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.88 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  34.11 
 
 		 508 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.97 
 
 		 510 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  32.42 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.94 
 
 		 539 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  34.25 
 
 		 527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.87 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.7 
 
 		 719 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.98 
 
 		 1017 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.4 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  33.57 
 
 		 537 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  33.49 
 
 		 507 aa  190  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  32.95 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  26.07 
 
 		 932 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  28.72 
 
 		 534 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  31.1 
 
 		 519 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  31.04 
 
 		 512 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.4 
 
 		 592 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  26.53 
 
 		 651 aa  177  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  30.93 
 
 		 503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  33.26 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  33.26 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  33.26 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  31.76 
 
 		 517 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  30.38 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  30.17 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.87 
 
 		 664 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  29.31 
 
 		 530 aa  170  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  34.45 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  29.05 
 
 		 532 aa  164  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  26.85 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  28.64 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  25.5 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 544 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  24.95 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  25.6 
 
 		 535 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  24.87 
 
 		 816 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  26.43 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  28.82 
 
 		 551 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  31.21 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  28.21 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  27.58 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  29.87 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  30.29 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  28.85 
 
 		 566 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  28.43 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  31 
 
 		 522 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  25.11 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  23.43 
 
 		 545 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  25.96 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  31.96 
 
 		 558 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  28.95 
 
 		 534 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  32.59 
 
 		 558 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  28.92 
 
 		 574 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  28.87 
 
 		 532 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  35.18 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  27.61 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  25.18 
 
 		 559 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  28.47 
 
 		 539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  25.56 
 
 		 554 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  25.38 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  30.92 
 
 		 622 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  28.26 
 
 		 539 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>