291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4044 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  62.32 
 
 		 539 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 539 aa  1087    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  62.96 
 
 		 541 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  69.57 
 
 		 536 aa  741    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  62.78 
 
 		 541 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  62.59 
 
 		 539 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  65.99 
 
 		 537 aa  691    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  59.64 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  60.78 
 
 		 514 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  57.37 
 
 		 570 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  57.58 
 
 		 568 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  57.07 
 
 		 578 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  55.28 
 
 		 576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  55.77 
 
 		 572 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  56.94 
 
 		 574 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  53.79 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0553  ATP-dependent DNA ligase  57.68 
 
 		 561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  52.56 
 
 		 613 aa  571  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3561  ATP dependent DNA ligase  52.15 
 
 		 614 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  52.03 
 
 		 622 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  55.94 
 
 		 532 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  55.76 
 
 		 531 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  52.65 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  55.76 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  57.45 
 
 		 622 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  58.62 
 
 		 648 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  57.67 
 
 		 630 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  42.61 
 
 		 576 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  40.22 
 
 		 584 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  41.52 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  41.61 
 
 		 533 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  41.53 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  41.61 
 
 		 534 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  41.68 
 
 		 532 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  40.28 
 
 		 551 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  38.45 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  43.14 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  40.07 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  40.07 
 
 		 532 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  39.79 
 
 		 552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  37.73 
 
 		 530 aa  309  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  40.18 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  37.89 
 
 		 535 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1105  ATP-dependent DNA ligase  39.12 
 
 		 552 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1145  ATP-dependent DNA ligase  39.58 
 
 		 552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.646236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  39.44 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  37.93 
 
 		 532 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  38.76 
 
 		 551 aa  303  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1134  ATP-dependent DNA ligase  40.1 
 
 		 553 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  37.45 
 
 		 538 aa  303  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  36.58 
 
 		 533 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  37.63 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  40.18 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  37.1 
 
 		 544 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  39.12 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  39.08 
 
 		 558 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  38.87 
 
 		 559 aa  296  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  41.2 
 
 		 563 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  39.44 
 
 		 561 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  38.08 
 
 		 567 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  37.48 
 
 		 571 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  37.33 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  34.84 
 
 		 551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  31.48 
 
 		 545 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  30.04 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  30.82 
 
 		 546 aa  253  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  30.16 
 
 		 546 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  32.68 
 
 		 554 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  30.69 
 
 		 576 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.71 
 
 		 1017 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  29.76 
 
 		 567 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.75 
 
 		 553 aa  143  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.56 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.2 
 
 		 592 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.57 
 
 		 550 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.89 
 
 		 531 aa  133  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.85 
 
 		 552 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.86 
 
 		 562 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.47 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.06 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  28.33 
 
 		 546 aa  127  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 584 aa  124  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  28.05 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.56 
 
 		 573 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  28.38 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.98 
 
 		 573 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.81 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.53 
 
 		 594 aa  118  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.39 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  34.3 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.02 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  28.47 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  29.12 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.44 
 
 		 573 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.42 
 
 		 588 aa  113  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 513 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  27.71 
 
 		 603 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  27.91 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  28.61 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.7 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>