231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00097 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  100 
 
 
1009 aa  2103    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  32.52 
 
 
939 aa  401  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  31.66 
 
 
1065 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  27.37 
 
 
994 aa  272  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  26.87 
 
 
584 aa  157  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  26.81 
 
 
584 aa  154  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  25.57 
 
 
719 aa  152  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  26.39 
 
 
584 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.67 
 
 
588 aa  147  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  25.37 
 
 
583 aa  146  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  24.81 
 
 
603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  24.49 
 
 
598 aa  138  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  26.01 
 
 
932 aa  135  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  27.64 
 
 
803 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.37 
 
 
590 aa  129  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  26.35 
 
 
549 aa  128  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.95 
 
 
582 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  29.19 
 
 
664 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  27.88 
 
 
651 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.26 
 
 
601 aa  121  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.89 
 
 
550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  22.53 
 
 
601 aa  112  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.58 
 
 
553 aa  107  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  23.9 
 
 
568 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.45 
 
 
583 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.31 
 
 
562 aa  104  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.1 
 
 
610 aa  101  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.07 
 
 
556 aa  99  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  26.12 
 
 
507 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.61 
 
 
522 aa  95.9  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  24.13 
 
 
547 aa  95.1  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.95 
 
 
594 aa  94.7  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.96 
 
 
573 aa  94  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.08 
 
 
573 aa  93.6  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.68 
 
 
592 aa  92.8  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.8 
 
 
531 aa  92.4  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  24.9 
 
 
546 aa  92.4  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.11 
 
 
552 aa  92.4  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.97 
 
 
592 aa  92  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.42 
 
 
1017 aa  92  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.81 
 
 
539 aa  92  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.57 
 
 
548 aa  92  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  23.36 
 
 
944 aa  90.9  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  27.67 
 
 
520 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  27.67 
 
 
520 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  27.67 
 
 
520 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  24.39 
 
 
567 aa  89  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  24.85 
 
 
508 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  27.38 
 
 
507 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50218  predicted protein  28.86 
 
 
1307 aa  84  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197489  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45463  predicted protein  28.86 
 
 
1307 aa  84  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.857955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  27.23 
 
 
512 aa  83.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.69 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  26.69 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.27 
 
 
573 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  29.14 
 
 
337 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  26.52 
 
 
513 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  23.67 
 
 
527 aa  80.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  24.1 
 
 
816 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  29.68 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.98 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  27.4 
 
 
533 aa  77.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  23.53 
 
 
511 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  27.15 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.13 
 
 
573 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  24.59 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  27.12 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  24.86 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  27.47 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  27.41 
 
 
863 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  23.47 
 
 
554 aa  74.3  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  24.71 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  28.82 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  24.14 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  27.41 
 
 
867 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  25.4 
 
 
546 aa  72.8  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  27.25 
 
 
822 aa  73.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  26.94 
 
 
845 aa  70.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.57 
 
 
576 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  25.87 
 
 
530 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  28.11 
 
 
856 aa  69.3  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  29.68 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  26.8 
 
 
900 aa  68.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.82 
 
 
506 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  25.14 
 
 
644 aa  67.4  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  25.3 
 
 
608 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  28.53 
 
 
832 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  24.04 
 
 
545 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  23.14 
 
 
533 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  26.92 
 
 
834 aa  65.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  27.38 
 
 
658 aa  65.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  27.34 
 
 
534 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  30.15 
 
 
321 aa  65.1  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  25.07 
 
 
534 aa  65.1  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.47 
 
 
350 aa  64.7  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  27.08 
 
 
833 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  23.53 
 
 
531 aa  64.3  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  27.76 
 
 
848 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  28.24 
 
 
656 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  24.13 
 
 
550 aa  63.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.664954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>