281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_08591 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  71.4 
 
 		 546 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  71.59 
 
 		 546 aa  781    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 545 aa  1085    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  70.66 
 
 		 546 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  44.02 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  40.11 
 
 		 544 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  40.26 
 
 		 534 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  38.84 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  41.77 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  42.54 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  40.29 
 
 		 584 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  38.95 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  39.59 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  40.52 
 
 		 532 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  38.53 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  38.24 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  38.35 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1105  ATP-dependent DNA ligase  39.75 
 
 		 552 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  38.72 
 
 		 530 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  39.65 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  38.46 
 
 		 532 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1145  ATP-dependent DNA ligase  39.58 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.646236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  37.95 
 
 		 558 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  39.01 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1134  ATP-dependent DNA ligase  39.36 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  37.3 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  37.52 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  37.19 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  41.06 
 
 		 530 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  37.65 
 
 		 567 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  37.57 
 
 		 562 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  36.46 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  37.04 
 
 		 559 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  37.56 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  36.68 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  37.32 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  37.28 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  39.45 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  39.56 
 
 		 533 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  35.84 
 
 		 563 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  31.22 
 
 		 550 aa  297  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  33.58 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  33.09 
 
 		 536 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  31.94 
 
 		 532 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.41 
 
 		 531 aa  282  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  31.41 
 
 		 570 aa  280  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  32.39 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  33.09 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  32.63 
 
 		 574 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  32.5 
 
 		 542 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  32.11 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  32.85 
 
 		 537 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  31 
 
 		 594 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  32.58 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  32.36 
 
 		 539 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  32.31 
 
 		 541 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  30.63 
 
 		 572 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  30.16 
 
 		 613 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  31.48 
 
 		 539 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0553  ATP-dependent DNA ligase  32.34 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  31.27 
 
 		 539 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  32.14 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  35.11 
 
 		 648 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  30.35 
 
 		 576 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3561  ATP dependent DNA ligase  36.12 
 
 		 614 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  34.06 
 
 		 622 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  33.55 
 
 		 630 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  31.68 
 
 		 622 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  29.45 
 
 		 576 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.04 
 
 		 1017 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  27.54 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.75 
 
 		 592 aa  153  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  25.37 
 
 		 546 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.27 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.73 
 
 		 562 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25 
 
 		 556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.65 
 
 		 509 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.41 
 
 		 567 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.3 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.69 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.48 
 
 		 573 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.57 
 
 		 610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  24.35 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.43 
 
 		 547 aa  136  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.3 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.69 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.21 
 
 		 573 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.05 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.38 
 
 		 548 aa  134  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  22.81 
 
 		 511 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.91 
 
 		 594 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  24.88 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  24.83 
 
 		 513 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  24.46 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  25 
 
 		 527 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  23.65 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.08 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  23.65 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.93 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  23.65 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>