278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06069 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  100 
 
 
932 aa  1918    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  50.66 
 
 
803 aa  688    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  51.22 
 
 
719 aa  663    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  47.31 
 
 
664 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  42.61 
 
 
651 aa  503  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  34.15 
 
 
816 aa  351  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  32.73 
 
 
944 aa  343  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  34.8 
 
 
583 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  34.38 
 
 
584 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  34.4 
 
 
584 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  32.48 
 
 
603 aa  326  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.3 
 
 
590 aa  326  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.79 
 
 
588 aa  325  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  33.48 
 
 
584 aa  323  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.69 
 
 
601 aa  321  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  32.13 
 
 
601 aa  308  3e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  31.92 
 
 
598 aa  296  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  32.52 
 
 
549 aa  258  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.95 
 
 
582 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.87 
 
 
583 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.45 
 
 
550 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.19 
 
 
552 aa  197  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  26.81 
 
 
568 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  26.23 
 
 
547 aa  188  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  26.22 
 
 
546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.14 
 
 
553 aa  181  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.15 
 
 
556 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.8 
 
 
592 aa  171  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  25.7 
 
 
567 aa  171  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.05 
 
 
573 aa  171  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.29 
 
 
562 aa  170  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.98 
 
 
594 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.41 
 
 
573 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.53 
 
 
548 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.62 
 
 
610 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.04 
 
 
573 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  34.57 
 
 
337 aa  162  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.78 
 
 
573 aa  162  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  25.9 
 
 
576 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  26.2 
 
 
1009 aa  137  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  27.56 
 
 
513 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  27.7 
 
 
513 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.5 
 
 
510 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.4 
 
 
509 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.31 
 
 
531 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  27.92 
 
 
513 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  29.38 
 
 
527 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.91 
 
 
539 aa  116  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  26.22 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  26.22 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  26.22 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  24.03 
 
 
994 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  25.49 
 
 
511 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  26.54 
 
 
534 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  27.74 
 
 
507 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.25 
 
 
506 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  22.84 
 
 
1017 aa  105  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  24.77 
 
 
508 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  24.37 
 
 
507 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  26.26 
 
 
797 aa  99.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25 
 
 
592 aa  99  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  26.8 
 
 
1065 aa  98.2  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  26.09 
 
 
519 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  27.31 
 
 
537 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  26.22 
 
 
512 aa  97.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  28.35 
 
 
939 aa  95.9  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  23.57 
 
 
584 aa  95.5  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  27.78 
 
 
855 aa  95.1  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  26.4 
 
 
351 aa  95.1  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  25.97 
 
 
558 aa  94.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  30.59 
 
 
831 aa  94.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  27.05 
 
 
833 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  27.24 
 
 
847 aa  92.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  26.55 
 
 
561 aa  91.3  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.19 
 
 
495 aa  91.3  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  25.19 
 
 
558 aa  91.3  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  25.05 
 
 
514 aa  91.3  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  26.79 
 
 
847 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  25.59 
 
 
321 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  23.13 
 
 
517 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  26.22 
 
 
872 aa  89.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  23.47 
 
 
546 aa  88.6  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  24.93 
 
 
546 aa  88.2  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  26.33 
 
 
871 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  23.03 
 
 
546 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  24.06 
 
 
552 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  26.05 
 
 
316 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  27.27 
 
 
833 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  27.11 
 
 
833 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.11 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  24.64 
 
 
570 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  26.2 
 
 
832 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.4 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  24.45 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  27.25 
 
 
828 aa  83.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  25.8 
 
 
509 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  25.63 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  24.87 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  24.03 
 
 
568 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  26.84 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>