More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13079 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  73.13 
 
 		 520 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  73.13 
 
 		 520 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 507 aa  1000    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  69.49 
 
 		 534 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  70.59 
 
 		 511 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  73.13 
 
 		 520 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  59.65 
 
 		 509 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  58.07 
 
 		 508 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  58.09 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  57.7 
 
 		 513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  58.61 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  56.7 
 
 		 522 aa  485  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  56.46 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  56.19 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  56.73 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  54.19 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  52.53 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  57.23 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  54.39 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  51.66 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  56.51 
 
 		 592 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  50.88 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  53.71 
 
 		 537 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  47.94 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.61 
 
 		 531 aa  290  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  37 
 
 		 567 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  37.36 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  50.29 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.08 
 
 		 552 aa  278  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.08 
 
 		 592 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.32 
 
 		 553 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.26 
 
 		 562 aa  240  5e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.61 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.05 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  34.02 
 
 		 546 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.79 
 
 		 550 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.62 
 
 		 573 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.4 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.13 
 
 		 573 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30 
 
 		 573 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  33.87 
 
 		 547 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.91 
 
 		 573 aa  210  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.61 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.14 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.05 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  32.76 
 
 		 584 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  32.54 
 
 		 584 aa  203  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.11 
 
 		 1017 aa  196  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  32.19 
 
 		 583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.45 
 
 		 590 aa  190  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  30.36 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  31.36 
 
 		 601 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  30.56 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.19 
 
 		 582 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  28.36 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.49 
 
 		 588 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.54 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  31.02 
 
 		 574 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  31.91 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.68 
 
 		 719 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 533 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  28.36 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  28.95 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  31.75 
 
 		 570 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  26.85 
 
 		 803 aa  134  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  26.99 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  36.62 
 
 		 522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  32.18 
 
 		 648 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  26.26 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.76 
 
 		 664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  29.78 
 
 		 532 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  29.71 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  28.07 
 
 		 534 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  26.42 
 
 		 530 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  33.75 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  28.5 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  29.54 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  32.26 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  31.49 
 
 		 514 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  23.57 
 
 		 545 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  31.7 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  26.51 
 
 		 932 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  30.89 
 
 		 568 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  29.71 
 
 		 551 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  29.44 
 
 		 622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  22.8 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  30.26 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  26.19 
 
 		 584 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  28.9 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  27.29 
 
 		 554 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  29.1 
 
 		 534 aa  120  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  23.5 
 
 		 546 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  24.75 
 
 		 816 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  23.15 
 
 		 546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  30.47 
 
 		 613 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  33.44 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  26.27 
 
 		 530 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  31.75 
 
 		 630 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  26.65 
 
 		 538 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>