More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4160 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 513 aa  958    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  93.37 
 
 		 513 aa  819    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  93.18 
 
 		 513 aa  890    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  72.8 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  59.8 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  57.93 
 
 		 508 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  58.98 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  55.41 
 
 		 534 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  57.12 
 
 		 507 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  57.9 
 
 		 527 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  57.33 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  57.33 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  57.33 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  55.6 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  56.24 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.03 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.16 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  54.95 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  55.88 
 
 		 592 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  53.8 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  51.07 
 
 		 507 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  53.09 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  51.61 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  47.74 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.56 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  52.82 
 
 		 442 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  31.39 
 
 		 567 aa  287  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  32.44 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.98 
 
 		 552 aa  282  9e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.96 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  41.23 
 
 		 592 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.25 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  36.78 
 
 		 576 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.79 
 
 		 562 aa  243  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.44 
 
 		 556 aa  239  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.39 
 
 		 550 aa  239  9e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  31.99 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  33.46 
 
 		 547 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.25 
 
 		 594 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.68 
 
 		 548 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.42 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.22 
 
 		 573 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.85 
 
 		 582 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.26 
 
 		 590 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.05 
 
 		 573 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  31.39 
 
 		 603 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.22 
 
 		 573 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.37 
 
 		 601 aa  210  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.01 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  33.4 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  34.12 
 
 		 584 aa  203  5e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  32.41 
 
 		 583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  31.51 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  34.12 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  32.53 
 
 		 584 aa  200  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  31.41 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.57 
 
 		 1017 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.43 
 
 		 583 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  30.71 
 
 		 530 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  33.06 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  29.39 
 
 		 803 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  25.88 
 
 		 816 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  32.67 
 
 		 533 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  29.78 
 
 		 664 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  32.45 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  31.73 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  36.45 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  36.9 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  36.21 
 
 		 622 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  31.37 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  36.18 
 
 		 630 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  30.4 
 
 		 552 aa  136  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  30.29 
 
 		 584 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  32.18 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 648 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  35.23 
 
 		 622 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  32.78 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  29.3 
 
 		 535 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  26.85 
 
 		 719 aa  133  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  34.65 
 
 		 531 aa  133  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  30.67 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  29.32 
 
 		 551 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  31.6 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  27.5 
 
 		 932 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  33.8 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  31.53 
 
 		 532 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  31.11 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  33.25 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  31.19 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  27.36 
 
 		 651 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  32.81 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  24.88 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  33.65 
 
 		 568 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  33.97 
 
 		 542 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  31.24 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  27.11 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  25.68 
 
 		 944 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>