272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_51005 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  100 
 
 		 651 aa  1345    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  47 
 
 		 664 aa  532  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  46.15 
 
 		 803 aa  529  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  43.16 
 
 		 719 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  42.47 
 
 		 932 aa  489  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  34.81 
 
 		 944 aa  382  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  33.74 
 
 		 603 aa  347  3e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  35.24 
 
 		 583 aa  344  2e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  33.9 
 
 		 584 aa  339  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  34.94 
 
 		 601 aa  335  1e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  34.57 
 
 		 816 aa  335  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  34.37 
 
 		 584 aa  333  8e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  33.39 
 
 		 584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.13 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.66 
 
 		 590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.52 
 
 		 588 aa  306  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  31.88 
 
 		 598 aa  300  7e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  31.6 
 
 		 549 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.39 
 
 		 583 aa  240  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.3 
 
 		 582 aa  237  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  27.64 
 
 		 568 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.44 
 
 		 567 aa  199  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.86 
 
 		 553 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.57 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  26.53 
 
 		 547 aa  177  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  37.21 
 
 		 337 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.25 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.72 
 
 		 550 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.8 
 
 		 594 aa  171  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.31 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.15 
 
 		 573 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.37 
 
 		 548 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.28 
 
 		 592 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.46 
 
 		 573 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.85 
 
 		 576 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.81 
 
 		 573 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  24.88 
 
 		 546 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.77 
 
 		 573 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.29 
 
 		 531 aa  133  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.81 
 
 		 610 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.14 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  30.52 
 
 		 513 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  30.89 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  27.36 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.42 
 
 		 1017 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  27.29 
 
 		 511 aa  123  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  27.88 
 
 		 1009 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  30.24 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.49 
 
 		 510 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.83 
 
 		 539 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  28.89 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 508 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  31.72 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  27.79 
 
 		 534 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  27.92 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  27.97 
 
 		 522 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  28.65 
 
 		 507 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  31.25 
 
 		 495 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  28.06 
 
 		 503 aa  106  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.78 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  30.7 
 
 		 351 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  29.43 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  29.48 
 
 		 847 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  29.43 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.2 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  28.87 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  27.86 
 
 		 568 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  27.95 
 
 		 532 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.95 
 
 		 592 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  27.21 
 
 		 994 aa  98.6  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  26.78 
 
 		 514 aa  98.2  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  26.07 
 
 		 570 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  27.27 
 
 		 321 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  26.27 
 
 		 539 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  26.96 
 
 		 584 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.09 
 
 		 797 aa  94.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  25.59 
 
 		 539 aa  93.6  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  27.32 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  26.32 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  26.11 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  28 
 
 		 831 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  27.88 
 
 		 1065 aa  92  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  24.62 
 
 		 546 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  25.57 
 
 		 566 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  23.61 
 
 		 939 aa  91.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  25.07 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  27.22 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3561  ATP dependent DNA ligase  27.06 
 
 		 614 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  26.51 
 
 		 530 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  26.58 
 
 		 576 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  26.73 
 
 		 536 aa  90.5  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  26.78 
 
 		 538 aa  90.5  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  26.3 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  27.34 
 
 		 576 aa  90.5  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  23.94 
 
 		 546 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  25.96 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>