More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0814 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 590 aa  1192    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  57.53 
 
 		 601 aa  665    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  51.69 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  53.2 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  52.84 
 
 		 603 aa  613  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  52.47 
 
 		 584 aa  590  1e-167  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  51.45 
 
 		 584 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  51.45 
 
 		 583 aa  579  1e-164  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  50.77 
 
 		 584 aa  580  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  47.7 
 
 		 588 aa  557  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  43.97 
 
 		 582 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.09 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  40.99 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  37.52 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  35.76 
 
 		 719 aa  363  6e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  34.3 
 
 		 932 aa  323  7e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  33.33 
 
 		 568 aa  309  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  32.66 
 
 		 651 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.11 
 
 		 552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  33.5 
 
 		 664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  31.7 
 
 		 567 aa  289  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.02 
 
 		 562 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  33.5 
 
 		 546 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.33 
 
 		 556 aa  266  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.28 
 
 		 573 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.34 
 
 		 573 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.47 
 
 		 547 aa  261  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  28 
 
 		 944 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.89 
 
 		 573 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.84 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.5 
 
 		 548 aa  257  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.09 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.99 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.77 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  30.32 
 
 		 816 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.62 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.6 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  33.26 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  32.35 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.05 
 
 		 594 aa  204  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.47 
 
 		 509 aa  203  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  30.44 
 
 		 508 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.99 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  33.86 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  31.32 
 
 		 527 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  30.13 
 
 		 520 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  30.13 
 
 		 520 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  30.13 
 
 		 520 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  30.15 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.03 
 
 		 522 aa  166  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.02 
 
 		 510 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.06 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  28.69 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  28.3 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  29.44 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  29.52 
 
 		 507 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.4 
 
 		 1017 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  31.87 
 
 		 519 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  34.76 
 
 		 337 aa  143  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.98 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.31 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  28.94 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  25.37 
 
 		 1009 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  28.31 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  29.6 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  30.63 
 
 		 550 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  32.47 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  25.6 
 
 		 532 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  27.58 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  24.75 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  27.93 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  29.3 
 
 		 584 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  27.44 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  24.59 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  27.42 
 
 		 558 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  29.25 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  33.81 
 
 		 847 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  26.46 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  27.2 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  28.27 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  29.5 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  24.03 
 
 		 535 aa  108  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  27.02 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  29.62 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  24.67 
 
 		 561 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  28.69 
 
 		 570 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  30.86 
 
 		 574 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1134  ATP-dependent DNA ligase  27.82 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  28.4 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  26.97 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  27.68 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  24.92 
 
 		 534 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  28.49 
 
 		 568 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  25.24 
 
 		 562 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  27.08 
 
 		 536 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  30.6 
 
 		 831 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  29.48 
 
 		 622 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  25.13 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>