More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0864 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  60.91 
 
 		 573 aa  701    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  61.61 
 
 		 573 aa  708    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  62.48 
 
 		 573 aa  717    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  61.26 
 
 		 573 aa  704    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 562 aa  1139    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  38.6 
 
 		 567 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.26 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  37.96 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  36.23 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.88 
 
 		 556 aa  356  5e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.14 
 
 		 548 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  35.26 
 
 		 546 aa  355  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.36 
 
 		 553 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.4 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.46 
 
 		 592 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.09 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.12 
 
 		 610 aa  296  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.69 
 
 		 588 aa  286  8e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  30.77 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  30.43 
 
 		 583 aa  277  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  30.94 
 
 		 584 aa  276  9e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.02 
 
 		 590 aa  273  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  30.77 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  31.17 
 
 		 603 aa  266  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  30.98 
 
 		 601 aa  264  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.89 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.39 
 
 		 583 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.31 
 
 		 582 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.42 
 
 		 601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  27.79 
 
 		 513 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  32.05 
 
 		 549 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  29.09 
 
 		 576 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  30.17 
 
 		 598 aa  238  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.73 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  25.36 
 
 		 513 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.17 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  29.95 
 
 		 527 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  29.18 
 
 		 511 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  28.82 
 
 		 520 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  28.82 
 
 		 520 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  28.82 
 
 		 520 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  27.3 
 
 		 803 aa  220  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  26.49 
 
 		 513 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  30.23 
 
 		 507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.98 
 
 		 1017 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  28.41 
 
 		 508 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  26.57 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  24.96 
 
 		 534 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  28.99 
 
 		 719 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.93 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  28.36 
 
 		 519 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.64 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  25.94 
 
 		 512 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  28.15 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  25.09 
 
 		 537 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  31.12 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  27 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.62 
 
 		 592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.18 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  25.31 
 
 		 651 aa  169  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  24.14 
 
 		 932 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.67 
 
 		 664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  30.83 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  26.92 
 
 		 550 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  30.46 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  23.76 
 
 		 816 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  27.76 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  27.53 
 
 		 532 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  25.58 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  26.94 
 
 		 622 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  30.53 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 538 aa  150  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  26.5 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  32.83 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  30.53 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  26.63 
 
 		 568 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  26.43 
 
 		 622 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  30.73 
 
 		 545 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  30.6 
 
 		 566 aa  146  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  28.24 
 
 		 572 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  27.93 
 
 		 648 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  25.73 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  27.16 
 
 		 534 aa  145  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  32.23 
 
 		 546 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  27.18 
 
 		 630 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  29.94 
 
 		 551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  30.25 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  29.15 
 
 		 552 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  28.16 
 
 		 533 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  27.85 
 
 		 533 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  28.08 
 
 		 576 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  32.23 
 
 		 546 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  25.37 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  29.3 
 
 		 561 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  29.08 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  29.32 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  28.24 
 
 		 536 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  27.27 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  25.17 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>