More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0878 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 594 aa  1148    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  57.69 
 
 		 592 aa  620  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  55.3 
 
 		 610 aa  609  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  58.72 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  44.73 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  42.16 
 
 		 556 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  39.6 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.57 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  38.4 
 
 		 568 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  44.46 
 
 		 548 aa  382  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  40.1 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  37.41 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.26 
 
 		 562 aa  323  7e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.82 
 
 		 573 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.99 
 
 		 573 aa  306  6e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.4 
 
 		 573 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.34 
 
 		 573 aa  299  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  34.34 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  32.75 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  33.17 
 
 		 583 aa  254  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  40.25 
 
 		 513 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  38.38 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  38.6 
 
 		 507 aa  250  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  38.77 
 
 		 527 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  32.26 
 
 		 603 aa  245  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  39.83 
 
 		 513 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.37 
 
 		 510 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  31.94 
 
 		 576 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  30.81 
 
 		 601 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.59 
 
 		 588 aa  236  7e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.64 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.82 
 
 		 531 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.43 
 
 		 539 aa  226  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.78 
 
 		 582 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  29.78 
 
 		 598 aa  224  4.9999999999999996e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  37.08 
 
 		 511 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  36.71 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.05 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.37 
 
 		 601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  29.73 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.55 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  39.79 
 
 		 513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.37 
 
 		 583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.19 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  36.43 
 
 		 512 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  30.02 
 
 		 803 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  39.49 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  36.69 
 
 		 537 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.01 
 
 		 1017 aa  196  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  37.08 
 
 		 517 aa  196  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  36.79 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  35.91 
 
 		 503 aa  193  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.33 
 
 		 719 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  26.8 
 
 		 651 aa  183  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  39.49 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.81 
 
 		 592 aa  178  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  27.29 
 
 		 932 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  31.24 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  30.75 
 
 		 533 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  25.45 
 
 		 664 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  30.49 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  28.04 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  31.28 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  27.13 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  34.9 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  28.18 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  34.69 
 
 		 648 aa  150  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  27.08 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  29.08 
 
 		 532 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  34.16 
 
 		 622 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  28.88 
 
 		 534 aa  143  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  31.25 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  34.52 
 
 		 578 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  34.24 
 
 		 561 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  34.53 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  31.38 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  32.87 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  33.12 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  35.44 
 
 		 630 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  31.17 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  35.03 
 
 		 622 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  34.24 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  29.91 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  33.03 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  26.91 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  31.49 
 
 		 552 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  25.8 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  33.9 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  31.23 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  31.16 
 
 		 544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  33.94 
 
 		 559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  27.57 
 
 		 576 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  27.3 
 
 		 546 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  27.27 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  32.65 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  31.31 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>