More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0427 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 531 aa  1053    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.39 
 
 		 552 aa  333  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.23 
 
 		 509 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  39.69 
 
 		 513 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  35.39 
 
 		 568 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  38.56 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  33.92 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  37.48 
 
 		 527 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.17 
 
 		 556 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.79 
 
 		 550 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  33.52 
 
 		 546 aa  300  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  36.31 
 
 		 508 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  33.64 
 
 		 547 aa  293  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.61 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  40.38 
 
 		 519 aa  286  9e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  38.43 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  35.32 
 
 		 507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  36.09 
 
 		 511 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.46 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.89 
 
 		 562 aa  279  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.51 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  35.08 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  35.08 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  35.08 
 
 		 520 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  33.85 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  36.09 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  33.8 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.19 
 
 		 573 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  33.16 
 
 		 584 aa  263  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.87 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.17 
 
 		 592 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.74 
 
 		 506 aa  260  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.45 
 
 		 576 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.72 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  32.06 
 
 		 583 aa  257  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.83 
 
 		 1017 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  35.14 
 
 		 509 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  33.58 
 
 		 534 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  33.59 
 
 		 512 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.67 
 
 		 573 aa  243  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.67 
 
 		 573 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.22 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.33 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  31.08 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  34.94 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  33.2 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.91 
 
 		 588 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  35.18 
 
 		 537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.7 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  32.71 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.24 
 
 		 594 aa  229  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  33.54 
 
 		 598 aa  228  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  35.22 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.8 
 
 		 590 aa  227  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.22 
 
 		 601 aa  225  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.12 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.83 
 
 		 583 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  28.41 
 
 		 803 aa  179  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  28.62 
 
 		 584 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  30.48 
 
 		 514 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  32.75 
 
 		 530 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  30.43 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  29.05 
 
 		 535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  31.41 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  28.92 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  30.02 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  30.07 
 
 		 533 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  29.54 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  31.71 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  30.67 
 
 		 533 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  29.69 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  27.6 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  26.24 
 
 		 719 aa  153  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  32.55 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  28.68 
 
 		 651 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  25.87 
 
 		 533 aa  150  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  29.89 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  28.3 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  26.07 
 
 		 816 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  28.82 
 
 		 570 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  36.48 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  28.73 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  29.76 
 
 		 648 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  25.5 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  28.96 
 
 		 568 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  28.74 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  27.48 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  29.24 
 
 		 622 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  26.95 
 
 		 558 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  30.53 
 
 		 664 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  29.93 
 
 		 535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  28.79 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  26.5 
 
 		 562 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  28.29 
 
 		 536 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  29.03 
 
 		 594 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  29.6 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  30.05 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  26.24 
 
 		 558 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  30 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  25.65 
 
 		 546 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>