More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1124 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 603 aa  1234    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  58.1 
 
 		 601 aa  694    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  60.14 
 
 		 584 aa  742    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  63.18 
 
 		 584 aa  774    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  60.98 
 
 		 584 aa  735    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  62.69 
 
 		 583 aa  761    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.01 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  52.84 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  50.59 
 
 		 598 aa  600  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  44.87 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  41.81 
 
 		 582 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.09 
 
 		 583 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  39.56 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  34.56 
 
 		 803 aa  359  8e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  36.44 
 
 		 568 aa  349  8e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  33.74 
 
 		 651 aa  347  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  33.33 
 
 		 719 aa  346  8.999999999999999e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  32.48 
 
 		 932 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  32.25 
 
 		 664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  31.93 
 
 		 567 aa  310  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.3 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  28.23 
 
 		 944 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.32 
 
 		 556 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.31 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  33.67 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.63 
 
 		 592 aa  276  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.36 
 
 		 550 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.17 
 
 		 562 aa  266  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  29.73 
 
 		 546 aa  256  8e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.26 
 
 		 548 aa  250  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.26 
 
 		 610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.64 
 
 		 573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  30.76 
 
 		 816 aa  236  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.46 
 
 		 573 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.8 
 
 		 573 aa  233  9e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.29 
 
 		 573 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.26 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.91 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.88 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  31.39 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  33.12 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  31.05 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  30.54 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.39 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  31.25 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  30.26 
 
 		 507 aa  184  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  30.07 
 
 		 534 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.32 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  30.26 
 
 		 507 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  27.22 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.32 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.93 
 
 		 539 aa  156  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.86 
 
 		 506 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  31.58 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  30.49 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  30.22 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  29.7 
 
 		 537 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.57 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  24.81 
 
 		 1009 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  26.64 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  30.19 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  29.18 
 
 		 550 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.94 
 
 		 1017 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  32.18 
 
 		 442 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  26.1 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  26.61 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  26.31 
 
 		 552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  27.11 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  25 
 
 		 552 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  25.69 
 
 		 530 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  32.74 
 
 		 847 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  25.21 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  27.22 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  26.76 
 
 		 541 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  26.87 
 
 		 939 aa  111  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  26.12 
 
 		 570 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  27.86 
 
 		 574 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  27.71 
 
 		 539 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  28.03 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  26.43 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  26.36 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  30.06 
 
 		 608 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  26.77 
 
 		 316 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  30.37 
 
 		 828 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  24.79 
 
 		 533 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  26.53 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  26.45 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  25 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  25.27 
 
 		 538 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  24.63 
 
 		 533 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  26.71 
 
 		 568 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  30.29 
 
 		 896 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  28.67 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  30.46 
 
 		 622 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  25.65 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  24.14 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>