More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2723 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  63.34 
 
 		 592 aa  687    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  60.26 
 
 		 610 aa  665    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 553 aa  1090    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  58.59 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  49.09 
 
 		 552 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  44.4 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  47.63 
 
 		 556 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  42.48 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  44.67 
 
 		 550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  43.51 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  42.52 
 
 		 546 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  46.84 
 
 		 548 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.39 
 
 		 562 aa  353  5e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.67 
 
 		 573 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.32 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.67 
 
 		 573 aa  349  9e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.62 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  37.54 
 
 		 584 aa  326  8.000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  38.23 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  36.99 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  37.03 
 
 		 583 aa  306  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  37.59 
 
 		 601 aa  286  5e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  32.83 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  32.82 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.89 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.19 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.92 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  39.61 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  40.96 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.02 
 
 		 583 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  33.15 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  40.49 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  40.28 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.97 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.85 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32.22 
 
 		 576 aa  250  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.18 
 
 		 531 aa  249  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.14 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.55 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  39.33 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  37.84 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.35 
 
 		 506 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  38.58 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  40.96 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  38.49 
 
 		 512 aa  230  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  42.5 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  37.53 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  37.53 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  37.53 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  38.67 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  36 
 
 		 537 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  38.77 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  35.86 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.84 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  30.72 
 
 		 719 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  32.4 
 
 		 803 aa  212  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.78 
 
 		 1017 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  35.39 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  37.88 
 
 		 592 aa  200  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  29.51 
 
 		 664 aa  193  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  27.73 
 
 		 651 aa  190  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  39.23 
 
 		 522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  27.97 
 
 		 932 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  33.87 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  39.11 
 
 		 442 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  33.5 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  33.01 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  33.25 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  33.05 
 
 		 558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  30.21 
 
 		 584 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  34.09 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  33.57 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  27.83 
 
 		 530 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  28.97 
 
 		 559 aa  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  29.86 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  28.18 
 
 		 554 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  29.86 
 
 		 532 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  32.59 
 
 		 534 aa  150  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  26.32 
 
 		 816 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.63 
 
 		 531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  30.68 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  36.27 
 
 		 561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  28.51 
 
 		 559 aa  148  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  34.58 
 
 		 622 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  30.96 
 
 		 539 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  25.59 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  26.68 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  33.96 
 
 		 648 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  29.18 
 
 		 622 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  29.29 
 
 		 544 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  30.1 
 
 		 551 aa  143  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  29.11 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  32.75 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  25.3 
 
 		 545 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  29.52 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  28.94 
 
 		 613 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  28.51 
 
 		 568 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  32.68 
 
 		 630 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  26.96 
 
 		 533 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  29.89 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>