113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00930 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  100 
 
 		 1065 aa  2207    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  32.84 
 
 		 1009 aa  353  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  28.54 
 
 		 939 aa  258  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  26.67 
 
 		 994 aa  185  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.32 
 
 		 588 aa  118  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  26.63 
 
 		 719 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  24.54 
 
 		 549 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.05 
 
 		 601 aa  107  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45463  predicted protein  27.18 
 
 		 1307 aa  107  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.857955  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50218  predicted protein  27.18 
 
 		 1307 aa  107  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197489  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  23.43 
 
 		 803 aa  102  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  29.86 
 
 		 664 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  23.57 
 
 		 598 aa  99  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  25.6 
 
 		 584 aa  97.8  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  25.26 
 
 		 601 aa  97.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  24.65 
 
 		 584 aa  97.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  24.74 
 
 		 583 aa  97.1  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.11 
 
 		 582 aa  96.3  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  25.94 
 
 		 584 aa  95.5  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.77 
 
 		 562 aa  95.5  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.18 
 
 		 590 aa  92.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  27.88 
 
 		 651 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  26.78 
 
 		 932 aa  91.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  23.56 
 
 		 603 aa  89.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  22.73 
 
 		 944 aa  83.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.09 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.6 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.58 
 
 		 583 aa  76.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.65 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.81 
 
 		 539 aa  73.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  25.05 
 
 		 568 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.13 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.05 
 
 		 556 aa  70.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.43 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  26.61 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  26.61 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  26.61 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  24.06 
 
 		 507 aa  67.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  23.75 
 
 		 527 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  23.57 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.95 
 
 		 610 aa  65.1  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  22.75 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  23.73 
 
 		 534 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.87 
 
 		 548 aa  64.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  23.21 
 
 		 816 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  22.6 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.14 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.38 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  26.45 
 
 		 816 aa  62.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  28.23 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  29.69 
 
 		 797 aa  60.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  28.02 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.61 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.66 
 
 		 592 aa  59.7  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  23.99 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.83 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  28.02 
 
 		 758 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  25.09 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  28.02 
 
 		 758 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  26.5 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  26.36 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  28.32 
 
 		 763 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  27.82 
 
 		 813 aa  57.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.19 
 
 		 778 aa  56.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  24.82 
 
 		 513 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.46 
 
 		 592 aa  55.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  26.79 
 
 		 512 aa  55.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.51 
 
 		 553 aa  55.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.62 
 
 		 573 aa  55.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  26.91 
 
 		 818 aa  55.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.52 
 
 		 350 aa  54.7  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.91 
 
 		 509 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  27.49 
 
 		 822 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.33 
 
 		 573 aa  53.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  26.13 
 
 		 337 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  27.11 
 
 		 895 aa  52.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.33 
 
 		 349 aa  52.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  27.78 
 
 		 831 aa  52.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  31.07 
 
 		 896 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  28.83 
 
 		 513 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2161  ATP dependent DNA ligase  27.04 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2316  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  27.04 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.52 
 
 		 346 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.8 
 
 		 902 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  25.5 
 
 		 856 aa  50.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  23.97 
 
 		 853 aa  49.7  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.24 
 
 		 573 aa  50.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  24.59 
 
 		 503 aa  49.7  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  34.85 
 
 		 901 aa  48.9  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  27.46 
 
 		 658 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  27.75 
 
 		 817 aa  49.3  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.53 
 
 		 594 aa  49.3  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  21.11 
 
 		 1017 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  27.07 
 
 		 911 aa  48.5  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.31 
 
 		 506 aa  48.5  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  26.84 
 
 		 882 aa  48.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  31.28 
 
 		 815 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  27.49 
 
 		 534 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  26.8 
 
 		 513 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  28.72 
 
 		 657 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>