18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50218 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50218  predicted protein  100 
 
 		 1307 aa  2717    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197489  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45463  predicted protein  100 
 
 		 1307 aa  2717    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.857955  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  24.05 
 
 		 994 aa  145  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  27.18 
 
 		 1065 aa  107  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  20.78 
 
 		 939 aa  85.1  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  28.86 
 
 		 1009 aa  84  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  24.27 
 
 		 598 aa  57.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  40.48 
 
 		 803 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  25.35 
 
 		 719 aa  56.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  25.6 
 
 		 932 aa  54.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  24.74 
 
 		 603 aa  50.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.2 
 
 		 588 aa  50.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.23 
 
 		 601 aa  50.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  25.76 
 
 		 944 aa  47  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  29.51 
 
 		 584 aa  46.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  26.62 
 
 		 584 aa  46.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  31.65 
 
 		 664 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  35.14 
 
 		 651 aa  45.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>