More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0952 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  35.95 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  34.74 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  38.65 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  33.02 
 
 		 608 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  34.33 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  33.23 
 
 		 871 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  36.42 
 
 		 896 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  32.38 
 
 		 872 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  31.43 
 
 		 847 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  29.38 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  31.23 
 
 		 861 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  32 
 
 		 534 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  28.66 
 
 		 896 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  26.84 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  31.14 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  33.01 
 
 		 902 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  34.29 
 
 		 855 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  27.74 
 
 		 436 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.43 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  29.87 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  28.57 
 
 		 656 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  28.3 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0365  ATP dependent DNA ligase  29.35 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  27.33 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.63 
 
 		 495 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  27.1 
 
 		 851 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  28.24 
 
 		 831 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  26.67 
 
 		 759 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  29.21 
 
 		 658 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  28.09 
 
 		 825 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.62 
 
 		 797 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  29.68 
 
 		 877 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  29.21 
 
 		 684 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  30.16 
 
 		 882 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  32.16 
 
 		 657 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  28.3 
 
 		 815 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  30.1 
 
 		 658 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  28.62 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  29.58 
 
 		 603 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  27.99 
 
 		 763 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  31.51 
 
 		 822 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.95 
 
 		 646 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  28.76 
 
 		 847 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.75 
 
 		 858 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  26.19 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  33.01 
 
 		 813 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  27.74 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  27.04 
 
 		 866 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  30.67 
 
 		 853 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  29.21 
 
 		 847 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  27.71 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  24.3 
 
 		 852 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  28.08 
 
 		 758 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  28.08 
 
 		 758 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  25.57 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  32.9 
 
 		 815 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  26.9 
 
 		 766 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4303  DNA ligase D  27.67 
 
 		 817 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  29.21 
 
 		 683 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  30.69 
 
 		 818 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  30.79 
 
 		 651 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  27.13 
 
 		 758 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  27.83 
 
 		 644 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  26.5 
 
 		 778 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  28.29 
 
 		 837 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  27.27 
 
 		 837 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  27.53 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  29.68 
 
 		 865 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  28.18 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  30.08 
 
 		 359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  28.62 
 
 		 863 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  28.8 
 
 		 867 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  29.15 
 
 		 843 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  27.83 
 
 		 913 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  25.6 
 
 		 816 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  28.48 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  31.55 
 
 		 940 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.72 
 
 		 582 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  28.05 
 
 		 825 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  25.38 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  27.49 
 
 		 568 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  28.85 
 
 		 848 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  29.97 
 
 		 1001 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  27.48 
 
 		 845 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  27.18 
 
 		 846 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  27.3 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0138  ATP dependent DNA ligase  26.82 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.465735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.37 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  27.92 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  28.13 
 
 		 355 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  30.41 
 
 		 868 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  27.9 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  25.84 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  25.16 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  25.16 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  27.92 
 
 		 939 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  25.99 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  27.91 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  27.91 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>