110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2834 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 358 aa  722    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 357 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  26.63 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  26.63 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  26.63 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  26.63 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  26.63 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  26.63 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  27.51 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  25.74 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  25 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  27.5 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  24.93 
 
 		 340 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  24.53 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  25.45 
 
 		 404 aa  89.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  22.71 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  26.53 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  26.53 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  23.99 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  24.36 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  20 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  20.67 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  22.88 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2779  type II secretion system protein  27.88 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  23.86 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  23.02 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  26.67 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  27.27 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  26.77 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  26.77 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  26.77 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  26.77 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  25.63 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  27.06 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  24.68 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  22.66 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  25.33 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  25.65 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  28.31 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  22.53 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  21.79 
 
 		 422 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  23.81 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  22.16 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  28.51 
 
 		 406 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  28.57 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  23.44 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_002620  TC0859  general secretion pathway protein F  18.42 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  26.83 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  26.12 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  26.12 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  23.12 
 
 		 405 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  23.12 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  27.31 
 
 		 407 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  23.27 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  24.52 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  22.15 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  23.71 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  21.49 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  22.65 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  17.62 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  23.85 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  22.66 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  22.66 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  23.48 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  22.66 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  22.66 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  24.43 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2309  putative GSPF-related transmembrane protein  22.07 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  20.62 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  25.52 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  25.75 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  28.39 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  23.4 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  21.94 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  22.42 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  16.74 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  21.94 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  16.74 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  22.3 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>