268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5876 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  100 
 
 		 358 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  100 
 
 		 358 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  63.69 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  64.25 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  64.25 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  64.25 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  64.25 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  64.25 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  64.25 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  63.69 
 
 		 358 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  37.97 
 
 		 357 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  37.1 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  32.85 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  32.85 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  28.44 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  29.11 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  27.55 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  23.3 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  25.56 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.28 
 
 		 340 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  25.31 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  23.46 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  22.51 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  25.84 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  24.46 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  25 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  21.68 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  27.03 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  22.69 
 
 		 408 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  25.18 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  19.81 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  24.5 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  24.62 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  22.67 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  21.52 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  22.69 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  23.93 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  25.64 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0383  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  21.88 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  25.27 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  24.14 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  24.64 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  31.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  30.53 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  22.03 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  21.73 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  24.64 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  24.64 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  24.64 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  24.64 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  23.37 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  21.79 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  23.68 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  28.46 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  21.49 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  21.49 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  30.53 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  26.16 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  24.75 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  28.06 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  24.75 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  24.75 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  23.84 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  28.74 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  24.75 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  27.16 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  21.2 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  20.85 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  25.52 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  24.75 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  24.08 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  24.01 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.2 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 422 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  29.77 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  24.2 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 420 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  23.84 
 
 		 405 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  23.16 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>