39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3730 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  100 
 
 		 366 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  48.62 
 
 		 365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  32.2 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  32.2 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  29.62 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  29.68 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  29.68 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  29.68 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  29.68 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  29.68 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  29.68 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  29.11 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  29.63 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  24.86 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  27.5 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  24.8 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  24.09 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  23.15 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  24.24 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  21.26 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  21.83 
 
 		 412 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0205  Type II secretion system F domain protein  25.55 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2777  hypothetical protein  24.65 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  25.58 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  21.97 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  21.97 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1432  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  21.97 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>