38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0064 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  100 
 
 		 354 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  25.71 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  24.43 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  24.43 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  24.43 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  24.43 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  24.43 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  24.43 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  28.16 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  26.19 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  25.31 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  25.36 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  25.36 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  25.55 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  21.28 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  22.71 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  23.34 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  22.22 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.81 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  21.05 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  25.82 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  22.25 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  22.51 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  22.71 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  19.53 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  22.01 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  21.85 
 
 		 404 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  22.65 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  21.46 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>