156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5913 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  100 
 
 		 358 aa  727    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  63.69 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  63.69 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  60.34 
 
 		 358 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  59.5 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  59.5 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  59.5 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  59.5 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  59.5 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  59.5 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  34.96 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  34.1 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  27.17 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  32.15 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  32.35 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  31.44 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  30.49 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  30.09 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  23.75 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  24.86 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  26.67 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  17.54 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  25.58 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  24.23 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  24.43 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  22.6 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  22.59 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  23.4 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  20.57 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  22.35 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  20.36 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  23.24 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  21.89 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  23.58 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  21.3 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  25.95 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  21.45 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  25.95 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  21.35 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  20.62 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  22.02 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  22.42 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  25.95 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  23.1 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  20.34 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  21.05 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  19.58 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  21.68 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  20.6 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  21.68 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  23.55 
 
 		 406 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  21.53 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  21.92 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  22.42 
 
 		 405 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 410 aa  49.3  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  22.35 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  18.51 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  19.85 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  19.68 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  21.36 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  22.38 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  22.34 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  33.09 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  18.67 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0102  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  21.01 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  25.29 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  21.57 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  23.6 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  18.93 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  24.35 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  18.93 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  18.93 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  18.93 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  18.92 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  21.7 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  20.63 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 419 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1811  pilus biogenesis protein, putative  26 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.620697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  26.14 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  19.88 
 
 		 421 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  24.65 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  21.47 
 
 		 339 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  19.5 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  22.63 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  20.97 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  22.11 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>