73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1513 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  100 
 
 		 363 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  44.13 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  44.13 
 
 		 359 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  35.45 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  34.91 
 
 		 365 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  30.29 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  29.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  29.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  29.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  29.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  29.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  29.7 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  29.39 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  32.69 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  30.49 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  26.69 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  26.91 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  27.53 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  21.65 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  22.13 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  19.77 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  24.83 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  20.32 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  24.48 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  19.77 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  21.24 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2182  general secretion pathway protein F  24.46 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  22.97 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  25.17 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  21.26 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  26.15 
 
 		 407 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  21.25 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  24.3 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0383  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  25.25 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  24.64 
 
 		 405 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  24.29 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  25.38 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  23.2 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  21.63 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  23.51 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  22.9 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  23.88 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  25.38 
 
 		 407 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  20.69 
 
 		 413 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  24.26 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  23.62 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3005  type II secretion system protein  24 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  22.81 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  22.78 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  24.12 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0932  type II secretion system protein  22.8 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  0.0185308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  25.37 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  22.45 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  21.73 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  22.08 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0580  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000819628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  21 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0544  general secretion pathway protein F  27.37 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  23.62 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0114  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.089481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  23.83 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  22.77 
 
 		 401 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  27.5 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>