27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4236 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  100 
 
 		 404 aa  827    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  27.42 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  24.32 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  24.49 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  25.45 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  23.06 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  24.8 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  24.07 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  22.67 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  22.67 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  25.62 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  21.85 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  22.92 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  22.92 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  22.92 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  22.92 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  22.92 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  22.92 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  22.13 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  23.05 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  22.67 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.88 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>