More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1606 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 358 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 358 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 358 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  100 
 
 		 358 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 358 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  95.53 
 
 		 358 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 358 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  64.25 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  64.25 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  59.5 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  38.84 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  40.06 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  32.37 
 
 		 359 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  30 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  30 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  30.77 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  29.43 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  29.97 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  25.85 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  26.63 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  20.47 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  25.47 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  25 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  23.51 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  24.33 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  21.69 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  21.69 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.12 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  25.6 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  24.85 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  25.89 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  24.46 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  24.7 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0383  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  26.41 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  24.48 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  28.22 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  24.63 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  25.15 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  27.21 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  22.8 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  27.07 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  23.39 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  27.11 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  21.87 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  27.13 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  25 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  21.87 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  23.84 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  20.06 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  21.87 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  26.87 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  21.87 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  23.21 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  22.82 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  26.02 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  22.92 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  23.48 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  26.52 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  23.37 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  26.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 417 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  26.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  26.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  26.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  26.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  26.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  23.96 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  24.41 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  23.44 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  23.12 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  24.4 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  22.03 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  24.24 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>