25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7247 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  100 
 
 		 372 aa  768    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  37.04 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  32.52 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  24.32 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  24.36 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.95 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  19.81 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  19.81 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  20.13 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  20.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  20.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  20.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  20.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  20.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  20.06 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  22.54 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  21.25 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  20.5 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  23.49 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  23.49 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  23.85 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  23.85 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  19.35 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  25.22 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  21.39 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>