95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0361 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  100 
 
 		 340 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  24.93 
 
 		 358 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  20.98 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  20.98 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  21.47 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  26.13 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  20.59 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  22.98 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  18.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  18.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  18.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  18.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  18.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  21.95 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  18.99 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  21.81 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  22.49 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  21.96 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  25.11 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  24.18 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  20.4 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  23.91 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  17.01 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  18.18 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  17.7 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  21.03 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  24.59 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  20.89 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  20.89 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  21.53 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  19.2 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  22.42 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  22.76 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  20.69 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  20.2 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  20.2 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  20.61 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  25.29 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3366  general secretion pathway protein F  23.38 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0261754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  24.09 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  19.94 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0681  general secretion pathway protein F  25.11 
 
 		 403 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  21.74 
 
 		 403 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 410 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 395 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  19.24 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  24.91 
 
 		 366 aa  49.7  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  20.42 
 
 		 405 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2097  putative pilus biogenesis protein  28.21 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000301688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  21.65 
 
 		 402 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  20.86 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0580  type II secretion system protein  22.08 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000819628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  20.06 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  22.58 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  23.44 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.42 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0614  type II secretion system protein  20.41 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0327  general secretion pathway protein F  22.71 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1811  pilus biogenesis protein, putative  27.27 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.620697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  20.82 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  22.31 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  19.82 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  22.56 
 
 		 410 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  19.69 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  23.36 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  23.22 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  21.98 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  21.79 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  20 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  21.88 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  21.07 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  23.08 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  23.08 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  20.11 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  19.69 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  20.71 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  21.67 
 
 		 411 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  18.13 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  18.94 
 
 		 406 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  20.12 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  22.56 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  20.59 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  22.56 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  22.56 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  22.56 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>