140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0018 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  100 
 
 		 359 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  36.31 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  36.31 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  32.37 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  32.37 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  32.1 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  30.03 
 
 		 365 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  30.55 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  28.16 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  25.43 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  26.13 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  21.73 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  21.73 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  23.41 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  21.97 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  20.95 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  20.6 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0859  general secretion pathway protein F  23.05 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  22.13 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  22.73 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  23.99 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  21.93 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  23.58 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4373  comG operon protein 2  24.13 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  20.61 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0830  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4096  type II secretion system protein  23.65 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0853  type II secretion system protein  22.26 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000781273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4320  comG operon protein 2  24.04 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  22.6 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  25.62 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  23.37 
 
 		 409 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  25.91 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 417 aa  52.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  22.51 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1730  type II secretion system protein  22.15 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.659448  normal  0.0266314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  22.39 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3222  type II secretion system protein  21.58 
 
 		 394 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.333811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  22.46 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  23.3 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1585  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0451652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4159  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4354  comG operon protein 2  24.91 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0044  type II secretion system protein  22.6 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0754  general secretion pathway protein F  22.73 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  22.38 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  21.75 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3665  type II secretion system protein  21.18 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  20.09 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  22.29 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  19.83 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  22.06 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4537  type II secretion system protein  21.32 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  19.71 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  21.99 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  21.99 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  23.79 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  22.29 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  22.49 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  22.29 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  21.5 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  22.29 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  20 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  21.5 
 
 		 416 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 405 aa  46.2  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  23.18 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3994  comG operon protein 2  23.53 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  24.54 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0231  type II secretion system protein  19.88 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.222775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0687  type II secretion system protein  25 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  20.65 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  24.1 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1271  type II secretion system protein  21.36 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1300  type II secretion system protein  24.26 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  21.85 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  22.49 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  21.45 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  21.58 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  21.35 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  21.31 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  21.78 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  21.71 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>