52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5433 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  100 
 
 		 346 aa  686    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  100 
 
 		 346 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  49.56 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  49.56 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  28.81 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  28.14 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  28.14 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  28.14 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  28.14 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  28.14 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  28.14 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  28.26 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  24.48 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  24.48 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  23.72 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  26.53 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  28.71 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  21.73 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  26.38 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  20.89 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  23.49 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2090  type II secretion system protein  24.91 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0804302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  22.6 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  20.42 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  21.95 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  21.96 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  22.38 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  22.05 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  23.91 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  28.03 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  24.33 
 
 		 402 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  26.95 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  20 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  25.1 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  25.61 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  19.63 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  22.86 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  25.64 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0102  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  25.64 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  22.61 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  22.96 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>