33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6560 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6560  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5556  type II secretion system protein  76.92 
 
 		 377 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  0.134799 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4704  hypothetical protein  24.76 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  22.3 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  22.3 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  22.88 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  22.22 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4207  type II secretion system protein  23.71 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4236  putative general secretion pathway protein  23.06 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  21.77 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  22.05 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4763  type II secretory pathway component PulF-like protein  20.44 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7247  type II secretory pathway component PulF-like protein  22.54 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0361  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein E  21.03 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.358963  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  20.6 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4495  hypothetical protein  21.33 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2721  type II secretion system protein  22.02 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0449144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  23.66 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  20.71 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  20.71 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  24.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  24.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  24.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  24.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  24.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  24.19 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3701  hypothetical protein  21.85 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6290  Type II secretory pathway component PulF-like protein  22.35 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.033403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  21.03 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>