25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0630 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0630  putative type IV pilus protein  100 
 
 		 388 aa  785    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0113  integral membrane protein  31.21 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3730  type IV pilus biogenesis protein PilR  29.41 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1513  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0018  type II secretion system protein F  25.43 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4475  type IV B pilus protein  26.5 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59310  type IV B pilus protein  26.5 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0474078  hitchhiker  0.000000000806613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5659  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.867335  hitchhiker  0.00476713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5876  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5447  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115593  normal  0.0802201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5244  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5913  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.649484  decreased coverage  0.00495524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0773  type IV pilus biogenesis protein  25.19 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.7274  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2834  Type II secretion system F domain protein  21.55 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0662  type IV pilus biogenesis protein  25.47 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1606  type IV pilus biogenesis protein  25.47 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2169  type IV pilus biogenesis protein  25.47 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0735578  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2253  type IV pilus biogenesis protein  25.47 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1983  type IV pilus biogenesis protein  25.47 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0652  BfpE  25.47 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778877  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0064  putative type IV secretion system protein PilR  21.05 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1537  type II secretion system protein  21.01 
 
 		 357 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0822651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5202  type II secretion system protein  21.01 
 
 		 357 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5027  type II secretion system protein  21.14 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5433  type II secretion system protein  21.14 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>